Trong miễn dịch học, kháng nguyên (Ag) là một phân tử hoặc cấu trúc phân tử có thể gắn vào một kháng thể đặc hiệu hoặc thụ thể tế bào T. Sự hiện diện của kháng nguyên trong cơ thể có thể kích hoạt phản ứng miễn dịch. Thuật ngữ kháng nguyên ban đầu đề cập đến một chất mà tạo ra kháng thể. Kháng nguyên có thể là protein, peptide, (chuỗi amino acid), polysaccharide (chuỗi monosaccharide/đường đơn), lipid, nucleic acid, hay phân tử sinh học khác.